Koronavirus: mutacije

in Christiane Fux, medicinska urednica Posodobljeno dne

Maximilian Reindl je študiral kemijo in biokemijo na LMU v Münchnu, od decembra 2020 pa je član uredniške ekipe Seznanil se bo z medicinskimi, znanstvenimi in zdravstvenimi temami, da bodo te razumljive in razumljive.

Več objav avtorja Maximilian Reindl

Christiane Fux je v Hamburgu študirala novinarstvo in psihologijo. Izkušeni medicinski urednik od leta 2001 piše revijske članke, novice in dejstva o vseh možnih zdravstvenih temah. Christiane Fux je poleg svojega dela za aktivna tudi v prozi. Njen prvi kriminalni roman je bil objavljen leta 2012, poleg tega pa piše, oblikuje in objavlja svoje kriminalne igre.

Več objav avtorja Christiane Fux Vse vsebine preverjajo medicinski novinarji.

Trenutno je delta varianta iz Sars-CoV-2 posebej zaskrbljujoča za strokovnjake: zdi se, da ni le bolj nalezljiva, ampak tudi nevarnejša od prvotne divje vrste. Druge mutacije so se izkazale za vsaj bolj nalezljive. Tu lahko ugotovite, kakšne lastnosti imajo različne mutacije koronavirusa, kje se širijo in zakaj cepljenja še vedno zelo dobro ščitijo.

Mutacije so normalne

Pojav novih variant virusa ni nič nenavadnega: virusi - vključno s patogenom Sars -CoV -2 - med razmnoževanjem večkrat naključno spremenijo svoj genski material. Večina takšnih mutacij je brez pomena. Toda nekatere so koristne za virus in prevladujejo.

Na ta način se lahko virusi hitro prilagodijo okolju in svojemu gostitelju. To je del njihove evolucijske strategije.

Medtem pa so se pri Sars-CoV-2 pojavile tako imenovane "Variants of Variant" (VoC)-torej različice, ki skrbijo strokovnjake. Skupno jim je, da so bolj nalezljive kot prvotna oblika Sars-CoV-2.

To so naslednje štiri različice:

• Alfa: Linija, znana tudi kot B.1.1.7, se razprostira iz Velike Britanije.
• Beta: Linija, znana tudi kot B.1.351, se razprostira iz Južne Afrike.
• Gama: Linija, znana tudi kot P.1, se razprostira iz Brazilije.
• Delta: Linija, znana tudi kot B.1.617, se razprostira iz Indije.

Različice virusov so združene v tako imenovane klade ali linije - raziskovalci ustvarijo nekakšno "družinsko drevo koronavirusa". Vsaka varianta je označena glede na genetsko sestavo in ima kombinacijo črk in številk. Iz te oznake ni mogoče ugotoviti, ali je določen virusni sev nevarnejši - uporablja se le za sistematično beleženje in dokumentiranje.

Mimogrede: Svetovna zdravstvena organizacija (WHO) je nedavno predlagala uvedbo novih imen za najpomembnejše različice Sars-CoV-2. Po podatkih Svetovne zdravstvene organizacije naj bi se posamezne različice virusa zdaj imenovale v naraščajočem vrstnem redu glede na grško abecedo.

Namen tega novega, enostavnejšega in predvsem nevtralnega opisa je preprečiti, da bi nove različice virusa enačili z lokacijo njihovega prvega odkrivanja. To naj bi preprečilo neupravičene in znanstveno neutemeljene stigme, diskriminacijo in predsodke do posameznih držav v javni razpravi.

Najverjetneje. Študija s Škotske, objavljena v ugledni reviji The Lancet, kaže, da je tveganje bolnišničnega zdravljenja okužbe z Delto dvakrat večje kot pri prvotni različici.

Ali cepljenje ščiti pred različico Delta?

Da. BioNTech / Pfizer ščiti 79 odstotkov pred boleznijo proti Delti po drugem odmerku cepljenja v primerjavi z 92 odstotki proti alfa različici, ki je bila prvotno odkrita v Veliki Britaniji. Po cepljenju z zdravilom AstraZeneca je zaščita po drugem odmerku cepljenja 60 odstotkov v primerjavi s 73 odstotki.

Te številke se nanašajo na blage in zmerne simptomatske poteke. Ne upošteva se, kako dobro cepljenje ščiti pred hudo boleznijo in smrtjo. Toda prav tu bi lahko bila stopnja zaščite bistveno boljša.

Delta virus - imunološka dejstva

Delta varianto koronavirusa (B.1.617) so prvič odkrili v Indiji. Prikazuje tri podvarijante in združuje več značilnih sprememb. Takšno združevanje je bilo prvič dokazano v različici virusa.

Po eni strani so to spremembe v beljakovini, ki velja za "ključ" človeške celice. Po drugi strani pa B.1.617 prikazuje tudi spremembe, o katerih se razpravlja kot (o možni) mutaciji pobega.

B.1.617 združuje naslednje pomembne mutacije:

Mutacija D614G: Lahko naredi koronavirus bolj nalezljiv. Začetno modeliranje kaže, da se B.1.617 prenaša vsaj tako enostavno kot zelo nalezljiva alfa različica (B.1.1.7).

Mutacija T478K: Privede do izmenjave nezapolnjene aminokisline treonina z lizinom na položaju 478, protoniranega v fizioloških pogojih - in s tem pozitivno nabite.Predpostavlja se, da ta izmenjava aminokislin vpliva na interakcijo z receptorjem ACE2. Strokovnjaki sumijo, da bi to lahko sprožilo hujše bolezni Covid-19.

Mutacija P681R: Raziskovalci to povezujejo tudi z možno povečano virulenco.

Mutacija E484K: Ugotovljena je bila tudi v različici beta (B.1.351) in različici gama (P.1). Sumi se, da je virus manj občutljiv na nevtralizirajoča protitelesa, ki so že nastala.

Mutacija L452R: Razpravlja se tudi kot možna mutacija pobega. Sevi koronavirusa z mutacijo L452R so bili v laboratorijskih poskusih delno odporni na določena protitelesa.

Druge znane variante virusa

Poleg tega so se razvile dodatne različice virusa Sars-CoV-2, ki se razlikujejo od divjega tipa-vendar jih strokovnjaki trenutno ne štejejo za HOS. Ti sevi virusov se imenujejo "Variants of Interest" (VOI) - to je variante posebnega pomena.

Zaenkrat ni jasno, kakšen vpliv bi te nastajajoče VOI lahko imele na pandemijo. Če bi se borili proti sevom virusov, ki so že v obtoku, bi jih lahko tudi nadgradili na ustrezne HOS.

Variante posebnega pomena

Po podatkih Evropskega centra za preprečevanje in obvladovanje bolezni (ECDC) ti VOI trenutno vključujejo:

• Eta: dokazano v mnogih državah (B.1.525)
• Iota: prvič odkrit v ZDA na območju New Yorka (B.1.526)
• Kappa: prvič odkrit v Indiji (B.1.617.1)
• Lambda: prvič odkrit v Peruju (c.37)

Poleg tega po ECDC obstajajo še drugi VOI, ki še niso opisani v skladu z novo nomenklaturo SZO:

• B. 1.620 neznanega izvora.
• B. 1621 prvič odkrit v Kolumbiji.

Po informacijah ECDC in WHO različice, ki so bile prej omenjene kot epsilon, zeta in theta, niso več del VOI. Različica B.1.616, ki je bila prvič odkrita v Franciji, je dolgo krožila tudi brez pomembnega vpliva na pandemijo.

Različice, ki jih opazujemo

V razširjenem poudarku so tudi tako imenovane "variante pod nadzorom" (VUM) - vendar še vedno primanjkuje zanesljivih, sistematičnih podatkov o teh. Večino časa obstajajo le dokazi o njihovem golem obstoju. Vključujejo občasno pojavljajoče se variante ali "spremenjene" - ali bolje rečeno, nadalje razvite - potomce že znanih mutacij.

Po podatkih ECDC ti redki VUM trenutno vključujejo:

• B.1.427 in B.1.429 - WHO jih je prej imenovala Epsilon, zdaj pa znižala bonitetno oceno, prvič odkrita v Kaliforniji.
• P.2 - WHO ga je prej imenoval Zeta, zdaj pa znižan, najprej odkrit v Braziliji.
• P.3 - WHO ga je prej imenovala theta, zdaj pa znižala oceno, prvič odkrila na Filipinih.
• B.1.214.2, A.27, A.28, C.16 in B.1.1.318 - različice neznanega izvora.
• Druge različice, ki so bile prvič odkrite v Južni Afriki: B.1.351 + E516Q in B.1.351 + P384L, C.1.2
• Druge različice, ki so bile prvič odkrite v Veliki Britaniji: B.1.1.7 + L452R in B.1.1.7 + S494P, A.23.1 + E484K, AV.1, B.1.671.2 + K417N
• Druge različice, ki so bile prvič odkrite v ZDA: B.1.526.1, B.1.526.2
• Različica, ki je bila prvič odkrita v Rusiji: AT.1
• Različica, ki je bila prvič odkrita v Egiptu: C.36 + L452R
• Različica, ki je bila prvič odkrita v Mehiki: B.1.1.519

Čeprav je zdaj znanih ogromno novih variant virusov, to ne pomeni samodejno večje grožnje. Ocena tveganja v tem trenutku še ni mogoča. Tudi vpliva tega VUM na (globalni) proces okužbe ni mogoče predvideti. Torej, ali so nekatere različice virusa pomembne ali nevarne, je mogoče razjasniti le z nadaljnjimi opazovanji.

Kako nevarne so mutacije koronavirusa?

Koronavirusne mutacije, ki so uradno uvrščene med "variante zaskrbljenosti", so glede na trenutno stanje znanja nevarnejše od divjega tipa koronavirusa. So zelo nalezljive in njihove ustrezne spremembe (ubežne mutacije) bi lahko spodbudile sekundarne okužbe.

Vendar splošna ocena, ali so druge mutacije koronavirusa nevarnejše od prvotnega patogena Sars-CoV-2, ni zlahka možna. Primanjkuje izkušenj in trdne baze podatkov, zlasti pri novonastalih različicah.

Kaj pomeni višja nalezljiva moč?

Če bo Sars-CoV-2 nalezljivejši, bo tudi težje ustaviti njegovo širjenje. Ukrepi, ki so doslej uspešno zajezili širjenje, potem morda ne bodo več zadostovali.

Če se na primer vrednost replikacije R za divjo obliko virusa zmanjša na 0,8 in se število okuženih ljudi postopoma zmanjša, bi se virus, ki je približno 35 odstotkov bolj nalezljiv, razširil še naprej in sprožil verige okužbe, če bi so bili sprejeti enaki ukrepi.

Kaj to pomeni za cepiva?

Na to ni splošnega odgovora. Možen zmanjšan zaščitni učinek na novo razvitih cepiv se živahno razpravlja v strokovnih krogih. Doslej so proizvajalci cepiv in predhodne preiskave v zvezi s tem dali vse jasno.

Comirnaty na primer v prvih študijah kaže primerljivo učinkovitost v primerjavi z alfa različico (B.1.1.7) in različico beta (B.1.351). Zdi se, da tudi VaxZevria zagotavlja dobro zaščito v B.1.1.7, vendar bi se lahko učinkovitost proti liniji B.1.351 zmanjšala.

V kolikšni meri se bodo druga cepiva iz družb Moderna in Johnson & Johnson obdržala proti spremenjenim različicam virusa, še ni dokončno pojasnjeno.

Ko virus napreduje, bodo morda potrebne prilagoditve cepiva. Zaradi napredka pri razvoju cepiva je to mogoče storiti v kratkem času. Vendar vsa cepiva, odobrena v Evropski uniji, še vedno zagotavljajo učinkovito in ustrezno zaščito - zlasti pred hudimi in smrtnimi poteki Covid -19.

Dodatne informacije o cepivih proti koronavirusu najdete tukaj.

Kako hitro mutira Sars-CoV-2?

V prihodnosti se bo Sars-CoV-2 še naprej prilagajal človeškemu imunskemu sistemu in (delno) cepljenemu prebivalstvu z mutacijami. Kako hitro se to zgodi, je v veliki meri odvisno od velikosti aktivno okužene populacije.

Več ko je primerov okužbe - regionalnih, nacionalnih in mednarodnih - bolj se koronavirus množi - in pogosteje se pojavljajo mutacije.

V primerjavi z drugimi virusi pa koronavirus mutira relativno počasi. S skupno dolžino genoma Sars-CoV-2 približno 30.000 baznih parov strokovnjaki predvidevajo eno do dve mutaciji na mesec. Za primerjavo: virusi gripe v istem obdobju mutirajo dva do štirikrat pogosteje.

Kako se lahko zaščitim pred mutacijami koronavirusa?

Pred posameznimi mutacijami koronavirusa se ne morete posebej zaščititi - edina možnost je, da se ne okužite.

Splošno pravilo je, da se držite higienskih pravil, se držite na razdalji in javno nosite masko FFP2. Če se cepite, boste uživali tudi dobro osnovno imunost proti hudim tečajem.

Kako se odkrijejo mutacije koronavirusa?

Nemčija ima tesno povezan sistem poročanja za spremljanje kroženja virusov Sars-CoV-2-imenuje se "integriran sistem molekularnega nadzora". V ta namen pristojni zdravstveni organi, Inštitut Robert Koch (RKI), specializirani diagnostični laboratoriji in svetovalni laboratorij za koronavirus v berlinski Charité tesno sodelujejo.

Kako deluje sistem poročanja, če obstaja sum na mutacijo?

Najprej je treba o vsakem strokovno opravljenem pozitivnem testu na koronavirus poročati pristojnemu zdravstvenemu organu.To vključuje teste na koronavirus, ki so bili opravljeni v testnem centru, pri zdravniku, v lekarni ali v vladnih ustanovah - na primer v šolah. Vendar pa so zasebni samotesti iz tega izključeni.

Dodatne informacije o hitrih testih koronavirusa za osebno uporabo najdete v naši temi posebni samopreizkusi Corone.

Če je rezultat pozitiven, zdravniki pošljejo ustrezen vzorec bolnika v specializiran diagnostični laboratorij, ki rezultat potrdi s testom PCR. Če je tudi test PCR pozitiven - lahko vzorec pošljemo tudi v laboratorij za sekvenciranje, kjer ga lahko dodatno pregledamo (analiza genoma sekvenciranja).

RKI nato na psevdonimiziran način primerja poročevalske podatke in rezultat analize zaporedja. Psevdonimiziran pomeni, da ni mogoče sklepati o eni osebi. Vendar pa ti podatki tvorijo podatkovno podlago za znanstvenike in deležnike v zdravstvenem sistemu, da bi dobili natančen pregled trenutnega stanja pandemije. To omogoča najboljšo možno oceno stanja, da se (če je potrebno) izvedejo politični ukrepi.

Kaj je analiza zaporedja genoma?

Analiza genoma sekvenciranja je podrobna genetska analiza. Preučuje natančno zaporedje posameznih komponent RNA znotraj virusnega genoma. To pomeni, da je genom Sars-CoV-2, ki obsega približno 30.000 baznih parov, dešifriran in ga nato lahko primerjamo z genom divjega tipa koronavirusa.

Le tako je mogoče posamezne mutacije prepoznati na molekularni ravni - in možna je razvrstitev v "družinsko drevo koronavirusa".

Zaporedje genoma je dolgotrajen in drag proces z (zelo) omejenimi zmogljivostmi. Zato ni mogoče vsak pozitiven vzorec rutinsko sekvencirati. Strokovnjaki naredijo predhodno izbiro - zato vzamejo vzorec.

S tem je tudi jasno, da vsaka država na svetu ne more natančno slediti natančnemu širjenju nekaterih variant koronavirusa. Zato je verjetno, da v razpoložljivih podatkih o poročanju obstaja nekaj nejasnosti.

Tags.:  droge prva pomoč organskih sistemov